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梨石细胞形成和Metacaspase基因的关系(3)
1.4 不同时期梨果肉中过氧化氢含量的测定
参照林植芳等[8-9]的方法。取0.5g样品,加入石英砂,按1:4的比例加入冷丙酮并研磨成匀浆,在4℃下(3000r•min-1)离心10min,取0.5mL上清液,加入0.5mL丙酮,再加入5%硫酸肽和浓氨水,静置,待形成沉淀后,离心(3000r•min-1 )10min,弃上清,沉淀用丙酮洗涤后加入2mol•L-1硫酸5mL,定容并与标准曲线比色,计算过氧化氢含量。过氧化氢与硫酸钛形成过氧化物,被H2SO4溶解后在415nm波长下比色测定。标准曲线的制作步骤同上。
1.5 梨果实细胞死亡基因筛选及克隆
1.5.1 Metacaspase基因序列收集和特征分析
从Pfam上下载Peptidase_C14的结构域PF00656,用HMMER3搜索到了桃,梅,苹果,草莓,梨这五种蔷薇科物种的全部Metacaspase基因序列,共发现了78个序列,用blast局部序列比,删除了21个序列。然后根据E值的大小,以及通过SMART检测是否有完整结构域,筛选出51个基因,其中,梨有12个基因,苹果存在20个,桃存在7个,草莓存在6个,梅也存在6个。然后通过ProtParam进行梨Metacaspase的氨基酸组成成分和理化性质分析, 在线计算氨基酸序列的
物理
和
化学
性质,其中指标包括:氨基酸长度、相对分子量、理论等电点等。其中,搜索到的梨Metacaspase同系基因
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