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甜菜夜蛾P450基因上游调控序列分析(3)
1.2.2 RT-PCR
定量PCR模板采用Vazyme公司的HiScriptII Q RT SuperMix for qPCR(+gDNA wiper):首先去除基因组DNA,将TotalRNA定到500 ng,然后加入SuperMix在25℃ 10min;50℃ 30min;85℃5min条件下进行逆转录反应。
1.2.3 定量PCR检测mRNA表达量
根据研究中获得的甜菜夜蛾CYP450基因的RNA全长,利用Primer Premier v.5.0软件设计多对引物,并对这些引物进行定量筛选,并选择出一对扩增效率高、特异性好的定量引物,同时选用GAPDH基因为内参(见表1)。本试验采用的荧光染料SYBR GreenⅠ可与所有的双链DNA结合,通过检测反应中SYBR GreenⅠ的荧光强度来反映出PCR产物扩增量。Q-PCR反应采用ABI 7300型荧光定量PCR仪(Applied Biosystems,Foster City,CA)。反应试剂选用康为世纪公司Ultra SYBR Mixture (with ROX),依据说明书在96孔PCR板中依次加入Template cDNA 2 μl、上下游引物各1 μl、2 × UltraSYBR Mixture(With ROX)12.5 μl、RNase-free Water 8.5 μl,共25μl。定量PCR反应程序为:95℃ 10min;95℃ 30 s, 60℃ 40s,添加溶解曲线,共40轮。利用Sequence Detection Software Version 1.4(Applied Biosystems)软件进行Ct值的计算、导出与溶解曲线分析。每个模板3次生物学重复,每个cDNA模板三次
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