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构建circRNA4235和circRNA4595转基因植物(3)
卡那霉素(kan)(50mg/ml)的)配制:
(1)溶解500mg卡那霉素于足量的水中,最后定容至10ml。
(2)分装成小份于-20℃储存。常以10ug/ml-50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
利福平(50 mg/ml)配制50ml:
(1)称取2.5g 利福平置于50ml塑料离心管中。
(2)加入40mlDMSO,振荡充分混合溶解之后定容50ml,可以涡旋。
(3)用0.45um的细菌过滤器过滤,分装(1ml每管),置于-20℃储存。
2.实验方法
2.1植物材料培养
拟南芥在植物培养室培养,培养条件设置为:光照 10h,温度22℃,空气相对湿度 75% ; 黑暗 14h,温度 22℃,空气相对湿度 75%。
2.2构建含有目的基因载体
2.2.1设计和合成引物
本实验使用Primer Premier
软件
,分别构建circRNA4235和circRNA4595基因过表达和突变型的上游和下游片段引物,由金斯瑞生物科技公司进行合成。
2.2.2拟南芥cDNA的获得[4](突变体)
2.2.2.1拟南芥总RNA的提取:
操作步骤:
(1)取0.1g4周的拟南芥叶片,在液氮中充分研磨后,加入1mlTrizol,使其充分裂解。可放置4℃ 冰箱;
(2)12,000rpm 离心10min,弃沉淀;
(3)按200ul氯仿,振荡混匀后室温放置5min;
(4)4℃ 12,000rpm离心15min;
(5)吸取上层水相500ul,至另一DEPC处理过的离心管中;
(6)加入等体积水相的异丙醇,加入3M醋酸钠50ul,放置-20℃冰箱中过夜沉淀;
(7)4℃ 12,000g离心20min,弃上清;
(8)按1ml 75%乙醇/ml Trizol加入75%乙醇,温和振荡离心管,悬浮沉淀;
(9)4℃ 8,000rpm离心5min,尽量弃上清。
(10)超净台中吹5-10min。注:RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解;
(11)加30ul DEPC处理过的H2O;
(12)测RNA浓度。注:此方法提取RNA A260/A280值在1.8-2.0之间;
2.2.2.2反转录得到cDNA
用随机引物反转录得到cDNA,RNA浓度为1ug/ul,反转录体系为20ul.
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