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抑制剂设计任务书
题目:靶向于流感病毒神经氨酸酶新位点的抑制剂设计专业:应用
化学
(中新)任务起至日期:一、课题的任务内容:本论文将采用3D-QSAR法,在SYBYL-X 2.0的水平下,在本
研究
中,选择出了32个抑制剂类似物来作为训练集,并分别进行分组和整体构建COMFA和COMSIA模型。COMFA和COMSIA力场图都为我们提供了有用的信息来帮助我们进行抑制剂类似物的结构更改建造。论文中研究讨论了现在出现的常规流感病毒药物神经氨酸酶抑制剂的作用机理,并且利用定量构效关系来研究神经氨酸酶抑制剂的 QSAR 模型。并基于此模型来设计新的神经氨酸酶 NA 类似物分子和进行结构修饰。31031
二、原始条件及数据:
原始资料来自于
文献
和指导教师提供的资料
三、设计的技术要求(论文的研究要求):
建立具有显著统计学意义,预测能力良好的3D-QSAR模型
四、毕业设计(论文)应完成的具体工作:
1.分子结构的搭建;
2.分子结构的优化;
3.分子的叠合;
4.3D-QSAR模型的建立;
5.模型的有效性检验、新型活性分子设计及结构修饰。
软硬件名称、内容及主要的技术指标(可按以下类型选择):
计算机
软件
SYBYL-X 2.0
结构模型 √
五、查阅文献要求及主要的
参考文献
要求:查阅中文文献10篇,外文文献10篇以上
主要参考文献:
1. GARCIA-SOSA A T,SILD S,MARAN U. Design of multi-binding-site inhibitors,ligand efficiency,and consensus screening of avian influenza H5N1 wildtype neuraminidase and of the oseltamivir-resistant H274Y variant[J]. J ChemInf Model, 2008, 48( 10) :2074 - 2080.
2. LANDON M R,AMARO R E,BARON R, et al. Novel druggable hot spots in avian influenza neuraminidaseH5N1 revealed by computational solvent mapping of a reduced and representative receptor ensemble[J].ChemBiol Drug Des, 2008, 71( 2) : 106 - 116.
吹冰、进度安排:(设计或论文各阶段的要求,时间安排):
求计算机应用能力和
英语
阅读能力较强工作计划:要求完成下列内容: 1.分子结构的搭建; 2.分子结构的优化; 3.分子的叠合;4.3D-QSAR模型的建立;5.模型的有效性检验、新型活性分子设计及结构修饰。工作计划:第1周 — 第3周查阅文献和收集资料。第4周 — 第13周分子结构的搭建、优化、模型的建立与验证第14周 — 第15周新型活性分子设计及结构修饰第16周 — 第18周撰写论文,准备答辩。
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