4。5 现有预测讨论 16

结语 19

致谢 20

参考文献 21

第一章绪 论

1。1DNA甲基化研究背景及意义

DNA甲基化是指在DNA中的胞嘧啶发生改变，导致一个甲基基团被加入到胞嘧啶中，这个过程在各类生物体的个体，组织，细胞中都普遍存在，但是甲基化程度却是具有差异性的。因为DNA中存在着大量的遗传信息，然而DNA甲基化可能导致遗传信息发生改变，从而影响基因的表达，因此个体的病症，老化，遗传，细胞的变化与DNA甲基化密切相关。为了对基因调控的机制进行进一步的说明也为了提高由甲基化引起的相关疾病的诊断与治疗，我们需要深入研究DNA甲基化，与恶性肿瘤，有性生殖、衰老的发生之间的关系。论文网

因此，加快DNA甲基化的研究进程将有利于提高疾病的治愈能力与揭开DNA隐藏的生命信息，还能帮助医学工作者研究出指定药物，对人类健康做出巨大贡献。

1。2DNA甲基化国内外研究现状

1。3 论文主要工作

DNA序列的甲基化识别方法研究中主要是针对DNA序列的甲基化识别，然而现阶段该论文主要是由RNA序列甲基化识别所引伸过来的，同样的还有蛋白质氨基酸的识别，大多数识别方法均是基于RNA检测，例如由理化性质，位置特异性，统计对称结构等方法提前相关的特征向量，在本文中主要利用化学属性和位置特异性的结合，提取DNA序列的特征向量，然后选用支持向量机[1,2,3]（SVM）作为预测工具，在DNA数据集DNA_sequence中进行实验，然后与其他方法得出结果进行比较。文献综述

本文主要采取化学属性及位置特异性结合的方法来提取DNA特征向量，主要方法就是先由各个核酸的化学属性，对4种核酸进行分组，嘌呤和嘧啶，氨基和酮类，强弱氢键，由（1，0）分别代表，然后将这四个核酸由（1，1，1）类型的向量表示出来，然后对由核酸组成的DNA序列进行密度划分，结合两者，便可以得出一个由化学属性和位置特异性相结合的DNA序列的特征向量，然后根据特征向量构建一个DNA序列样本甲基化位点检测的分类器，通过Jackknife进行交叉验证，通过Sp、Sn、ACC和MCC等指标对实验结果进行评价。

第二章 DNA概述

2。1 DNA的含义及表达方式

DNA是染色体的主要化学组成成分，也还是组成基因的基因分子，所以说DNA也被称之为“遗传分子”。DNA中包含着巨大数量的遗传信息。我们通常将DNA的序列不发生改变，但基因表达却发生了可遗传的改变称之为表观遗传。这样子的改变只是细胞内其他可遗传物质发生的改变，但是遗传信息却没有变化，并且在个体发育和细胞增殖过程中这种可遗传物质的改变是能够稳定遗传的。

DNA又称脱氧核糖核酸，是一种双链结构的分子，它是由脱氧核糖、磷酸及四种含氮碱基组成，它可以生成出指导遗传的命令，引领着个体生物成长发育与生命体制变化运行。它的主要功能是长期性的储存遗传信息，我们经常称之为生命蓝图。其中由DNA生成的指令，也就是由遗传信息表达出来的物质就是用来形成细胞内其他的物质，例如RNA与蛋白质所需要的物质就是通过DNA指令生成的。在DNA中，因为有些DNA片段存储着遗传信息，我们称之为基因，然而不存储遗传信息的DNA序列，都各自具有自己的功能，有的直接为自身构成提供帮助作用，有的则参与调整控制遗传信息，然而即使组成最简单的生命也最少要265到350个基因。来`自+优-尔^论:文,网www.chuibin.com +QQ752018766-