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基于蛋白质组学的云南白药治疗溃疡性结肠炎药效物质基础研究(4)
原始数据通过Proteome Discoverer(PD)软件进行分析处理。蛋白的鉴定由SEQUEST搜索引擎完成。肽段分子质量误差允许范围设置在10 ppm以内,离子碎片误差设置在在0.02 Da,允许≤2处胰蛋白酶切割位点发生错误。多肽的带电荷状态被设置为+ 2和+ 3。对于蛋白质定量,要求一种蛋白质包含至少两个特有肽段。最终只有含量变化≥1.5倍且P-value<0.05的蛋白质被认定为显著差异表达蛋白质(differential expressed proteins,DEPs)。
1.6.4 DEPs生物信息学分析
通过运用OmicsBean网站(http://www.omicsbean.cn)和cytoscape软件对这些差异蛋白进行GO(Gene Ontology)富集,KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析,蛋白与蛋白相互作用分析(Protein-Protein Interaction,PPI),寻找云南白药治疗溃疡性结肠炎的靶点相关蛋白和相关通路。
2 结果与分析
2.1 病理学评估结果
曾有报道表明,将云南白药溶解在饮用水中能够有效缓解实验小鼠的结肠炎症状。而在本实验中,则验证了云南白药中的皂苷成分对于DSS引起的UC模型确实具有减缓作用。
实验表明第四天后,饮用DSS的两组小鼠体重相对于对照组显著减轻,从第五天开始,治疗组相对于造模组减轻的程度显著变小。DAI评估也显示了相同的趋势,评分越高说明症状越严重,在第四天后,治疗组相比造模组得分显著降低,说明云南白药的治疗有效减轻了小鼠溃疡性结肠炎症状(图1,A、B)。与此同时,通过比较8天后四组小鼠的结肠长度,可以发现造模组和治疗组相比对照组长度都有减短,但治疗组明显要长于造模组(图1,C、D)。从结肠组织的病理学切片可以看出,造模组有明显的炎细胞浸润,组织完整度较低,治疗组有相同情况,但相比于造模组情况较好。组织学损伤评分情况同样显示了云南白药对DSS引起的溃疡性结肠炎有明显的治疗效果
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