高分子与硝酸酯相互作用的模拟研究(7)
BTTN60模型 NG60模型
图3.1 BTTN、NG模型搭建
使用MS中的Visualizer模块，构建无规聚合物。在Build/Build Polymer/Random Copolymer创建PEG。本文构建的PEG包括745个原子，共个106个链接（图3.2）。
图3.2 PEG模型
在Materials Studio软件中，MD模拟过程，起始原子运动速度按Maxwell分布确定，牛顿运动方程的求解建立在时间平均等效于系综平均、周期性边界条件等基本假设之上，积分采用Velocity Verlet方法。选择具有很好普遍适用性和精准性的COMPASS力场，选取NPT系综。在298K的温度下，温度和压力的控制分别采用Velocity Scaling[24]和Berendsen[25]方法，范德华（vdw）和静电作用（Coulomd）长程非键作用分别采用atom-based[26]和Ewald[27]方法完成模拟过程，截断半径取9.5Åm。
总模拟时间2ns，前1ns用于热力学平衡，后1ns用于统计分析，每10fs取样一次，共得10000帧轨迹。使用MS的Forcite对轨迹进行内聚能密度和溶解度参数进行计算。
3.3平衡判别与结果分析
3.3.1体系平衡判别
判别MD模拟达到平衡是以温度和密度为标准的，温度和密度必须同时达到平衡，体系才达到平衡。对于温度和密度在5%～10%之间波动，即认为体系达到平衡。在298K下，对PEG、BTTN和NG1000000步热力学平衡，1000000步统计分析。其统计阶段的温度-时间（A）和密度-时间（B）的曲线如图3.3.温度和密度的波动均较平缓，充分说明体系已达到平衡。表3.1为各纯组分平衡密度和文献密度。图3.4是PEG的MD平衡结构。与图3.2相比，MD平衡后的PEG结构发生了较大的变化。我们同时得到了平衡时各组分的密度，并与其文献密度进行对比，见表3.2。
图3.3 温度、密度变化曲线
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